Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD3A2A2Y4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms