Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG1Q9Y678 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms