Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2E3Q9Y5X4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms