Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms