Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX11Q9Y5W9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms