Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD2APQ9Y5K6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD2APQ9Y5K6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms