Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y534

CSDC2, Cold shock domain-containing protein C2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDC2Q9Y534 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSDC2Q9Y534 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSDC2Q9Y534 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms