Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms