Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms