Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms