Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms