Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUDCQ9Y266 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms