Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCE1Q9Y256 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RCE1Q9Y256 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms