Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG5Q9UPR3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms