Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms