Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX12Q9UMY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms