Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI3Q9ULW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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