Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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