Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.2 ms