Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALD1Q9ULE6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms