Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PADI1Q9ULC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms