Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH9Q9ULB4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH9Q9ULB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH9Q9ULB4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH9Q9ULB4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms