Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA2Q9UL42 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA2Q9UL42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA2Q9UL42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA2Q9UL42 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA2Q9UL42 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms