Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms