Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBE1Q9UJT0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms