Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SALL4Q9UJQ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms