Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms