Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms