Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX4Q9UIU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms