Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEBQ9UHD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIDEBQ9UHD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIDEBQ9UHD4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms