Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC3Q9UHC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC3Q9UHC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms