Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MLH3Q9UHC1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.81■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms