Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO40Q9UH90 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms