Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms