Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3BQ9UH17 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms