Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms