Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms