Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms