Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms