Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms