Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EIF3KQ9UBQ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms