Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms