Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF2Q9P2I0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms