Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH4Q9P2E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms