Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MBD5Q9P267 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms