Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCHIP1Q9P0W5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms