Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMCD1Q9NZU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms