Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP53Q9NZM5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP53Q9NZM5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms