Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms