Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH8Q9NYR8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms